6月9日🧑🏼‍🏫，醫學院陳亮教授聯合中科院生物物理研究所楊鵬遠研究員👩‍🦼、斯坦福大學Mark M. Davis教授，在《Nature Cell Biology》雜誌在線發表了題為“Single-cell epigenomic landscape of peripheral immune cells reveals establishment of trained immunity in individuals convalescing from COVID-19”的論文。

該工作通過單細胞ATAC-seq技術以及新開發的單細胞多組學Ti-ATAC-seq技術，描繪了新冠肺炎康復者外周免疫細胞可接近染色質多維圖譜，解析了康復者中單核細胞，B細胞和T細胞免疫記憶形成的表觀遺傳機製。

在某些病毒感染或者疫苗接種後能誘導天然免疫細胞表現出類似於適應性免疫細胞的免疫記憶特征，也就是“訓練有素的免疫力（trained immunity）”。本論文結果表明，新冠肺炎康復者的天然免疫細胞和適應性免疫細胞都發生了大量的染色質重塑。康復者外周血中富集了TBET-enriched CD16⁺和IRF1-enriched CD14⁺monocytes，鑒定為訓練有素的（trained）和激活的表觀狀態。在B細胞譜系分析中，新冠肺炎康復者各個階段的B細胞表現出IgG類別轉換以及抗體分泌漿細胞樣分化。

在T細胞譜系分析中🚴🏽‍♀️，研究者新建了一個單細胞多組學Ti-ATAC-seq新技術🚣🏽‍♀️，可以同時在單細胞水平獲取每個T細胞的可接近染色質信息，TCR序列🔽，以及蛋白表面分子表達水平。新冠肺炎康復病人中CD8⁺T細胞表觀遺傳圖譜和單細胞TCR克隆性的深入分析揭示了病毒誘導的效應CD8⁺T細胞在初始新冠病毒控製和記憶CD8⁺T細胞在免疫記憶形成中發揮了關鍵作用。

論文由万事平台🤵🏿‍♀️、中科院生物物理所、斯坦福大學✦、解放軍總醫院第五醫學中心等單位合作完成。陳亮教授🧽🤦🏽‍♂️、楊鵬遠研究員😝⁉️、Mark M Davis教授為本文的共同通訊作者🧑🏽‍🏭。陳亮教授🚥，中國科學院生物物理研究所博士生遊茂軍，解放軍第五醫學中心張大偉、趙鵬博士為本文共同第一作者。

文章鏈接🟦：https://www.nature.com/articles/s41556-021-00690-1

Nature cell biology同期評論文章鏈接：https://www.nature.com/articles/s41556-021-00689-8